Varese è la provincia lombarda che vanta più siti UNESCO, ben 4 su 11: Sacro Monte, Monte San Giorgio, l'area archeologica di Castelseprio-Torba e l'Isolino Virginia.

Il complesso del Sacro Monte di Varese comprende la Via Sacra e le sue 14 Cappelle, tutte diverse tra loro e perfettamente inserite nell'ambiente naturale circostante, che conducono al Santuario di Santa Maria del Monte. 

Riconosciuto nel 2010 patrimonio UNESCO, il Monte San Giorgio è da annoverare tra i più importanti giacimenti fossiliferi al mondo del Triassico Medio, un'epoca geologica compresa tra 247 e 237 milioni di anni fa.

Complesso di origini romane, l’area archeologica di Castelseprio, è situata su una collina nei pressi della chiesa sconsacrata di Santa Maria Foris Portas, che ospita un ciclo di affreschi risalenti al V secolo. 

L'Isolino Virginia è un triangolo di terra che si trova a pochi metri dalla riva occidentale del Lago di Varese, nel territorio di Biandronno: uno dei siti più famosi della preistoria europea e ospita un museo archeologico e un ristorante.